MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis CCDC5079 chromosome

Total Repeats: 96472

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017523	CAC	2	6	27	32	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385993126
2	NC_017523	GTC	2	6	46	51	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993126
3	NC_017523	GAC	2	6	79	84	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993126
4	NC_017523	CAG	2	6	90	95	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993126
5	NC_017523	TCG	2	6	167	172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993126
6	NC_017523	AGC	2	6	199	204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993126
7	NC_017523	GCC	2	6	260	265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993126
8	NC_017523	CCG	2	6	304	309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993126
9	NC_017523	CGAC	2	8	311	318	25 %	0 %	25 %	50 %	385993126
10	NC_017523	CGA	2	6	324	329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993126
11	NC_017523	GCC	2	6	339	344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993126
12	NC_017523	ACG	2	6	389	394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993126
13	NC_017523	GAT	2	6	396	401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385993126
14	NC_017523	CCCG	2	8	588	595	0 %	0 %	25 %	75 %	385993127
15	NC_017523	AC	3	6	642	647	50 %	0 %	0 %	50 %	385993127
16	NC_017523	GGCA	2	8	659	666	25 %	0 %	50 %	25 %	385993127
17	NC_017523	GTT	2	6	680	685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385993127
18	NC_017523	CGA	2	6	809	814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993127
19	NC_017523	TTC	2	6	855	860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385993127
20	NC_017523	CAA	2	6	887	892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385993127
21	NC_017523	TCATC	2	10	901	910	20 %	40 %	0 %	40 %	385993127
22	NC_017523	CCCA	2	8	917	924	25 %	0 %	0 %	75 %	385993127
23	NC_017523	AGC	2	6	925	930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993127
24	NC_017523	ACC	2	6	992	997	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385993127
25	NC_017523	CGA	2	6	1061	1066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993127
26	NC_017523	CAG	2	6	1085	1090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993127
27	NC_017523	GC	3	6	1120	1125	0 %	0 %	50 %	50 %	385993127
28	NC_017523	GCG	2	6	1236	1241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993127
29	NC_017523	CCG	2	6	1258	1263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993127
30	NC_017523	CA	3	6	1407	1412	50 %	0 %	0 %	50 %	385993127
31	NC_017523	CAC	2	6	1490	1495	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385993127
32	NC_017523	CGTTT	2	10	2091	2100	0 %	60 %	20 %	20 %	385993128
33	NC_017523	GTGG	2	8	2131	2138	0 %	25 %	75 %	0 %	385993128
34	NC_017523	GCCA	2	8	2149	2156	25 %	0 %	25 %	50 %	385993128
35	NC_017523	CGGTGC	2	12	2163	2174	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	385993128
36	NC_017523	GTT	2	6	2185	2190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385993128
37	NC_017523	CCG	2	6	2241	2246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993128
38	NC_017523	TTG	2	6	2303	2308	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385993128
39	NC_017523	CGA	2	6	2406	2411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993128
40	NC_017523	TTG	2	6	2462	2467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385993128
41	NC_017523	ATT	2	6	2476	2481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385993128
42	NC_017523	TCAG	2	8	2493	2500	25 %	25 %	25 %	25 %	385993128
43	NC_017523	CGC	2	6	2509	2514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993128
44	NC_017523	GAC	2	6	2522	2527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993128
45	NC_017523	GGT	2	6	2575	2580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385993128
46	NC_017523	CGT	2	6	2634	2639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993128
47	NC_017523	GCC	2	6	2690	2695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993128
48	NC_017523	CGG	2	6	2707	2712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993128
49	NC_017523	CGTT	2	8	2719	2726	0 %	50 %	25 %	25 %	385993128
50	NC_017523	GCA	2	6	2793	2798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993128
51	NC_017523	CTT	2	6	2807	2812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385993128
52	NC_017523	AC	3	6	2854	2859	50 %	0 %	0 %	50 %	385993128
53	NC_017523	CCA	2	6	2868	2873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385993128
54	NC_017523	GC	3	6	2931	2936	0 %	0 %	50 %	50 %	385993128
55	NC_017523	GAT	2	6	2987	2992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385993128
56	NC_017523	TTG	3	9	3015	3023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385993128
57	NC_017523	ACGG	2	8	3071	3078	25 %	0 %	50 %	25 %	385993128
58	NC_017523	GCCT	2	8	3133	3140	0 %	25 %	25 %	50 %	385993128
59	NC_017523	CGG	2	6	3204	3209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993128
60	NC_017523	CGGTT	2	10	3240	3249	0 %	40 %	40 %	20 %	385993128
61	NC_017523	GGTA	2	8	3464	3471	25 %	25 %	50 %	0 %	385993129
62	NC_017523	GTG	2	6	3498	3503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385993129
63	NC_017523	ACG	2	6	3505	3510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993129
64	NC_017523	CAA	2	6	3554	3559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385993129
65	NC_017523	ATC	2	6	3575	3580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385993129
66	NC_017523	TGT	2	6	3622	3627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385993129
67	NC_017523	GGTT	2	8	3646	3653	0 %	50 %	50 %	0 %	385993129
68	NC_017523	CGG	2	6	3672	3677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993129
69	NC_017523	GAT	2	6	3687	3692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385993129
70	NC_017523	GT	3	6	3811	3816	0 %	50 %	50 %	0 %	385993129
71	NC_017523	TGG	2	6	3868	3873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385993129
72	NC_017523	CCGC	2	8	3874	3881	0 %	0 %	25 %	75 %	385993129
73	NC_017523	GAA	2	6	3914	3919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385993129
74	NC_017523	AGC	2	6	4028	4033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993129
75	NC_017523	GGC	2	6	4043	4048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993129
76	NC_017523	GGC	2	6	4052	4057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993129
77	NC_017523	GAC	2	6	4110	4115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993129
78	NC_017523	GGC	2	6	4199	4204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993129
79	NC_017523	TGG	2	6	4226	4231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385993129
80	NC_017523	GTT	2	6	4241	4246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385993129
81	NC_017523	CGA	2	6	4250	4255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993129
82	NC_017523	CGG	2	6	4300	4305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993129
83	NC_017523	CCG	2	6	4312	4317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993129
84	NC_017523	CCG	2	6	4357	4362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993129
85	NC_017523	GGT	2	6	4421	4426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385993129
86	NC_017523	TGC	3	9	4531	4539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993130
87	NC_017523	CG	5	10	4541	4550	0 %	0 %	50 %	50 %	385993130
88	NC_017523	GTCGG	2	10	4588	4597	0 %	20 %	60 %	20 %	385993130
89	NC_017523	CGA	2	6	4610	4615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993130
90	NC_017523	GGT	2	6	4744	4749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385993130
91	NC_017523	CCA	2	6	4753	4758	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385993130
92	NC_017523	ACG	2	6	4791	4796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993130
93	NC_017523	CGC	2	6	4876	4881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993130
94	NC_017523	CGG	2	6	4926	4931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993130
95	NC_017523	CG	3	6	4977	4982	0 %	0 %	50 %	50 %	385993130
96	NC_017523	AAG	2	6	5255	5260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385993131
97	NC_017523	GGT	2	6	5383	5388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385993131
98	NC_017523	CGA	2	6	5401	5406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993131
99	NC_017523	TGC	2	6	5442	5447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993131
100	NC_017523	CGA	2	6	5473	5478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993131
101	NC_017523	CCAC	2	8	5499	5506	25 %	0 %	0 %	75 %	385993131
102	NC_017523	ACCG	2	8	5518	5525	25 %	0 %	25 %	50 %	385993131
103	NC_017523	GTG	2	6	5531	5536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385993131
104	NC_017523	CGG	2	6	5554	5559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993131
105	NC_017523	TGG	2	6	5590	5595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385993131
106	NC_017523	CGGCGT	2	12	5602	5613	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	385993131
107	NC_017523	GGT	2	6	5617	5622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385993131
108	NC_017523	CAAG	2	8	5713	5720	50 %	0 %	25 %	25 %	385993131
109	NC_017523	AAG	2	6	5732	5737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385993131
110	NC_017523	CGCC	2	8	5809	5816	0 %	0 %	25 %	75 %	385993131
111	NC_017523	CAA	2	6	5839	5844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385993131
112	NC_017523	CGA	2	6	5866	5871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993131
113	NC_017523	GTC	2	6	5891	5896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993131
114	NC_017523	TGG	2	6	6009	6014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385993131
115	NC_017523	AGC	2	6	6056	6061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993131
116	NC_017523	GGC	2	6	6176	6181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993131
117	NC_017523	GC	3	6	6204	6209	0 %	0 %	50 %	50 %	385993131
118	NC_017523	GGT	2	6	6217	6222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385993131
119	NC_017523	AAGGAC	2	12	6254	6265	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	385993131
120	NC_017523	AGACCA	2	12	6348	6359	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	385993131
121	NC_017523	GCG	2	6	6520	6525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993131
122	NC_017523	CGGC	2	8	6624	6631	0 %	0 %	50 %	50 %	385993131
123	NC_017523	ATC	2	6	6692	6697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385993131
124	NC_017523	GC	3	6	6710	6715	0 %	0 %	50 %	50 %	385993131
125	NC_017523	ATC	2	6	6752	6757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385993131
126	NC_017523	ACG	2	6	6780	6785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993131
127	NC_017523	TGT	2	6	6867	6872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385993131
128	NC_017523	GTT	3	9	6877	6885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385993131
129	NC_017523	CCG	2	6	6935	6940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993131
130	NC_017523	CTG	2	6	7007	7012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993131
131	NC_017523	GAA	2	6	7033	7038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385993131
132	NC_017523	CAA	2	6	7042	7047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385993131
133	NC_017523	ACC	2	6	7109	7114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385993131
134	NC_017523	GT	3	6	7131	7136	0 %	50 %	50 %	0 %	385993131
135	NC_017523	GAC	2	6	7154	7159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993131
136	NC_017523	GCC	4	12	7160	7171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993131
137	NC_017523	GTT	2	6	7177	7182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385993131
138	NC_017523	CG	3	6	7210	7215	0 %	0 %	50 %	50 %	385993131
139	NC_017523	GACA	2	8	7304	7311	50 %	0 %	25 %	25 %	385993132
140	NC_017523	GCC	2	6	7319	7324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993132
141	NC_017523	GAC	2	6	7326	7331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993132
142	NC_017523	CAG	2	6	7362	7367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993132
143	NC_017523	GCAGC	2	10	7373	7382	20 %	0 %	40 %	40 %	385993132
144	NC_017523	TCG	2	6	7408	7413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993132
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146	NC_017523	CGGT	2	8	7524	7531	0 %	25 %	50 %	25 %	385993132
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149	NC_017523	CGG	2	6	7672	7677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993132
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152	NC_017523	CTG	2	6	7818	7823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993132
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155	NC_017523	ACG	2	6	7924	7929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993132
156	NC_017523	CGA	2	6	7931	7936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993132
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168	NC_017523	GCT	2	6	8570	8575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993132
169	NC_017523	CGA	2	6	8582	8587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993132
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172	NC_017523	CAT	2	6	8651	8656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385993132
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174	NC_017523	CGA	2	6	8741	8746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993132
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176	NC_017523	ATC	2	6	8793	8798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385993132
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247	NC_017523	GC	3	6	14267	14272	0 %	0 %	50 %	50 %	385993136
248	NC_017523	CCCG	2	8	14325	14332	0 %	0 %	25 %	75 %	385993136
249	NC_017523	TGAT	2	8	15013	15020	25 %	50 %	25 %	0 %	385993137
250	NC_017523	GGCGT	2	10	15032	15041	0 %	20 %	60 %	20 %	385993137
251	NC_017523	TGCT	2	8	15060	15067	0 %	50 %	25 %	25 %	385993137
252	NC_017523	GCT	3	9	15074	15082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993137
253	NC_017523	GCC	2	6	15084	15089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993137
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256	NC_017523	ACC	2	6	15207	15212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385993137
257	NC_017523	GGC	2	6	15254	15259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993137
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259	NC_017523	GGC	2	6	15293	15298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993137
260	NC_017523	GGGCC	2	10	15315	15324	0 %	0 %	60 %	40 %	385993137
261	NC_017523	TGG	2	6	15325	15330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385993137
262	NC_017523	CG	3	6	15373	15378	0 %	0 %	50 %	50 %	385993137
263	NC_017523	CAT	2	6	15482	15487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385993137
264	NC_017523	TGC	2	6	15523	15528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993137
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387	NC_017523	GCG	2	6	21181	21186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993142
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498	NC_017523	C	6	6	25702	25707	0 %	0 %	0 %	100 %	385993145
499	NC_017523	CCA	2	6	25739	25744	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385993145
500	NC_017523	GTC	2	6	25774	25779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993145

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